Los principales aspectos del derecho indígena son: el reconocimiento de sus derechos y demandas dentro de la Constitución mexicana, y si bien la Carta Magna contempla dichos sistemas, aún existe un largo camino por recorrer en materia de derechos de los pueblos indígenas en este país; específicamente en cuanto a autonomía de las comunidades para administrar sus asuntos internos, tomar decisiones y aplicar justicia de acuerdo con sus propias tradiciones y normas, lo que incluye la elección de autoridades y la resolución de conflictos; y finalmente, los derechos sobre sus territorios ancestrales, incluido el acceso y uso de recursos naturales. 

La relación entre el derecho indígena y el Ejército Zapatista de Liberación Nacional (ezln) está estrechamente vinculada a la lucha por el reconocimiento y la autonomía de los pueblos indígenas en México, por lo cual el ezln ha sido un actor clave en su promoción y defensa, en la visibilización de sus necesidades y en la implementación de políticas a su favor.