En la época prehispánica, acontecimientos como guerras, sequías e inundaciones contribuyeron principalmente al desarrollo de enfermedades gastrointestinales en 1446, 1448 y en 1450, cuando se registró un descenso de la temperatura en el Valle de Anáhuac. Con la llegada de los españoles, y ante la falta de un sistema inmune capaz de hacer frente a las nuevas enfermedades, y las carencias propias de las guerras desatadas, la población se vio fuertemente afectada. Tal es el caso de la viruela ―traída a México en 1520 por un esclavo de raza negra, Francisco de Eguía, quien padecía la enfermedad―, que causó la muerte de más de dos millones de personas, principalmente indígenas, siendo hasta 1950 una de las enfermedades más devastadoras para la población mexicana. Otras enfermedades que llegaron con la conquista ocasionando pandemias fueron el tifus o tabardillo, ampliamente documentada por fray Jerónimo de Mendieta durante un brote en 1595. El sarampión llegó en 1531 y podemos encontrar registrada en la Historia general de las cosas de Nueva España de Sahagún la salmonella, cuyas dos epidemias más fuertes se dieron en 1545 y en 1576; la fiebre amarilla, de la cual se registran diversas epidemias, una de las más importantes en 1883, dejando 2,500 muertes, y que se propagara rápidamente debido al crecimiento de las vías férreas durante el Porfiriato. La lepra, la polio, la sífilis y la influenza son otras de las enfermedades que forman parte de la historia de la salud en México.